Depende de cuánto de un déficit calórico y la duración del déficit.
Atrofia
Si el déficit es menor, su cuerpo no se catabolizará (consumirá por energía) sus células musculares, pero no las reemplazará activamente, solo mantendrá suficiente músculo para que su cuerpo sobreviva. Esto se llama atrofia muscular. Puede tomar un tiempo para que se note, y si comienzas a ejercitarte de nuevo y comes bien, los recuperarás.
Nota al margen: puedes ganar músculo en un déficit, es complicado. Requiere estímulo y proteína. Las dietas cetogénicas han sido eficaces en el crecimiento muscular y la quema de grasa.
Si come con un déficit severo o se priva de comida o se estresa excesivamente, su cuerpo descompondrá los aminoácidos en busca de energía debido a la liberación de cortisol y glucagón para mantener sus niveles de azúcar en la sangre. Tus músculos se desgastarán más rápido, solo se mantendrán en niveles mínimos para que puedas funcionar.