Depende de lo que quieras lograr.
Si solo quieres un entrenamiento, cualquiera de los dos es bueno.
Si está buscando obtener potencia aeróbica y posiblemente capacidad anaeróbica, por ejemplo, para poder correr 5k más rápido, vaya por omisión. Si está tratando de obtener más capacidad aeróbica, para que pueda aumentar su distancia de carrera, vaya a trotar.
Por supuesto, es una respuesta aproximada, también depende de cómo se ejecute o se salte.
La pregunta no es cuál es mejor, la pregunta es cuál se adapta mejor a sus necesidades.
