Como alguien que vive en el Reino Unido y ha comido manzanas toda mi vida sin pelar, diría que es perfectamente seguro.
No conozco a nadie que haya sufrido algún efecto negativo que se haya atribuido a residuos en el exterior de la fruta.
Tiendo a enjuagarme con agua del grifo antes de comer, pero eso es más para enjuagar el polvo de la fruta que ha estado en un frutero.
¿Hay alguna preocupación específica que tengas sobre la fruta en Europa, en lugar de en otro lugar?