¿Puedo enfermarme al comer alimentos cocinados / preparados con las manos sucias?

Eso depende de la razón (a qué versión de “sucio” le preocupa) y, dada la respuesta al primero, posiblemente el grado en que se cocina la comida después de ser tocada. Los alimentos contaminados con otras cosas que no sean patógenos pueden permanecer tóxicos después de la cocción, dependiendo de si el calor hace que el químico no sea tóxico o no.