¿Ha evolucionado el gen CLOCK con el tiempo para aumentar nuestro ciclo circadiano a medida que la velocidad de rotación de la Tierra disminuye gradualmente?

Sí, pero no por la razón por la que pregunta. Los cambios en la velocidad de rotación de la Tierra ocurren a lo largo de millones de años, muy lentamente en el tiempo biológico. Los cambios correspondientes en la duración del día de esta ralentización son muy pequeños. Compare esto con los cambios en la duración del día a medida que uno se mueve a latitudes más altas desde los trópicos. Estos cambios pueden ser sorprendentes. Piense en las 24 horas de la noche en invierno y las 24 horas en verano. Los organismos (como los humanos) que comenzaron cerca de los trópicos y terminaron poblando latitudes más altas durante decenas o cientos de miles de años (mucho más rápido que los cambios planetarios) han desarrollado variantes en CLOCK y otros genes del ritmo circadiano que probablemente ayudan a los ritmos biológicos a ajustarse a estos principales diferencias en el fotoperíodo.