Hice la misma pregunta dentro de este hilo en BioCurious Google Group, donde uno de los colaboradores de American Gut, Jason Bobe, habló para ayudar a explicar el proyecto. Independientemente, conversé con Jessica Richman, una de las fundadoras de uBiome, sobre su proyecto y la diferencia entre él y American Gut. Compartiré lo que tenían que decir y luego describiré algunas diferencias entre los dos, mis propios puntos de vista antropológicos y las diferencias mensurables.
Tripa americana
Citando a Jason Bobe (Director Ejecutivo en Personal Genome Project)
Lo que más me gusta del equipo estadounidense Gut es que tienen un banco profundo de científicos que tienen un historial comprobado de producir un gran trabajo de microbioma. Algunos realmente trabajaron en el Proyecto Microbioma Humano, o escribieron las herramientas de análisis de datos (por ejemplo, QIIME) que todos utilizan, u optimizaron los protocolos de extracción de ADN, o ayudaron a configurar una infraestructura de alto rendimiento para administrar miles de muestras, etc. Estoy Siempre me preocupa que las personas realmente entreguen lo que dicen que ofrecerán cuando se trata de proyectos de crowdfunding. No tengo ese tipo de preocupaciones con el proyecto American Gut. He trabajado con varios de los científicos en algunos proyectos de microbioma (conozco a Rob Knight desde hace 10 años y tengo otros 2 estudios microbiológicos en curso con él, incluido un estudio que caracteriza los microbiomas de 5 sitios corporales para participantes de PGP).
uBiome
Después de hablar con Jessica Richman, me llevé a casa el mensaje de que la diferencia importante no radica en cómo se realizan las pruebas (las técnicas son casi idénticas) sino en cómo se administran los datos. Para uBiome, el énfasis recae en los datos de crowdsourcing analizados por uBiome, que luego se envían directamente a la comunidad, y los datos brutos también están disponibles para el análisis personal. También me enteré de que uBiome ofrece más sitios de prueba que American Gut.
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Sitios de muestreo | Precio por sitio de prueba
uBiome : GI, boca, piel, nariz, genitales | $ 79
American Gut : heces, piel, orales | $ 99
American Gut ha dado algunos giros en su muestreo:
- extenso análisis de microbioma por $ 15,000
- verán microbiomas de perros y gatos
- tienen planes para comparar lo que encuentran en el intestino típico de Estados Unidos con unos pocos cientos de personas en las zonas rurales de Namibia, que comen lo que se describe como tarifa de cazadores-recolectores
Ambos proyectos citan el Proyecto de microbioma humano de $ 173 millones de dólares del NIH como el estándar para las pruebas de microbioma. En particular, el Proyecto de microbioma humano analizó datos de solo 250 participantes. Los proyectos financiados por crowdfunding tienen expectativas de participación mucho más altas.
American Gut quiere inscribir a 10,000 personas de todo el país ( nacional ). uBiome espera inscribir a 2.000 personas de todo el mundo ( internacional ).
A partir de hoy (28 de enero de 2012), American Gut ha recaudado $ 245,470 de su objetivo de $ 400,000. Su campaña termina el 2 de febrero. uBiome ha recaudado $ 199,238 de su meta de $ 100,000. La campaña termina el 31 de enero. Ambos proyectos están recaudando dinero en IndieGoGo, donde los proyectos retienen todo el dinero que recaudaron, independientemente de si se cumple el objetivo. American Gut no ha cumplido su objetivo y no está claro si esto impedirá el progreso o disminuirá los beneficios para los donantes existentes.
Mis pensamientos : uBiome es una startup de Silicon Valley dirigida por académicos y empresarios ex y actuales. American Gut parece ser un esfuerzo en gran parte académico y con influencia de la costa este. (El proyecto en sí tiene su sede en Nueva Orleans, LA). Si ha vivido en ambas costas, probablemente haya notado una diferencia geográfica / cultural en la forma en que los empresarios hacen negocios. Uno está más entusiasmado y concentrado en el crecimiento en la etapa inicial. No digo que este sea el caso aquí, pero muchas compañías en Silicon Valley comienzan sin que los fundadores tengan idea de lo que están haciendo. Esto no es necesariamente algo malo, pero da una cierta sensación a la experiencia del consumidor. Las empresas de la costa este tienden a estar más abotonadas, más pensadas antes de dar el primer paso y menos dispuestas a correr riesgos. Las empresas académicas son como las empresas de la costa este, pero con una perspectiva mucho más larga y, a menudo, un calendario (léase: puede tomar mucho tiempo antes de que haya resultados disponibles).
Aunque inicialmente estaba en la cerca, decidí optar por la campaña de uBiome simplemente porque, cuando doné, su campaña de crowdfunding estaba mejorando y porque costaba $ 20 más o menos por lo mismo. Al final, todo lo demás se mantuvo igual, lo que importa es contra cuántas personas puede compararse. Ambos proyectos han podido atraer a más de 1,000 participantes, lo cual es un comienzo bastante bueno. Creo que a ambos proyectos les va a ir bien. Será divertido ser uno de los primeros en adoptar este análisis y observar qué nuevos hallazgos surgen sobre el microbioma global. Estamos tratando de llevar el aprendizaje un paso más allá con una posible clase de microbioma humano en BioCurious. (https://groups.google.com/forum/…)
Actualización, 1 de febrero : American Gut ofrece un sitio de prueba adicional por $ 49 (debe agregarse a un pedido existente). uBiome extendió su campaña al 18 de febrero.
