Depende de lo que quieras hacer con eso.
La margarina es un ácido graso endurecido de origen vegetal. Los ácidos grasos son una cadena larga de hidratos de carbono, generalmente con uno o con enlaces insaturados. Por lo general, contiene ácidos grasos oleico, linoleico y esteárico unidos a un glicerol con un enlace éster. 
El diesel es carbohidrato, generalmente una mezcla que contiene entre 12 y 17 átomos de carbono en una cadena. Solo están hechos de carbono e hidrógeno y no hay enlaces insaturados. 
Entonces, puedes ver que químicamente son muy diferentes. y por lo tanto tienen un uso diferente. Ninguno de los dos es “mejor”, simplemente son diferentes.