¿Las instrucciones médicas que dicen “con las comidas” significan antes, después o durante?

Significan durante, o muy poco después.
Algunos medicamentos funcionan mejor cuando se absorben junto con los alimentos y algunos medicamentos pueden causar irritación estomacal leve, por lo que comer primero ayuda a alinear el estómago.

Significa que debes tomar el medicamento mientras hay alimento en tu estómago. Puede hacer cualquiera de los anteriores, siempre que sea cercano al momento en que toma su medicamento.