Sería difícil encontrar cualquier desventaja médica del sueño de onda lenta en sí mismo. Pero debido a que es más difícil despertar de este tipo de sueño, es posible que no responda a una emergencia como un incendio, una invasión a su hogar o incluso un problema médico que empeora rápidamente.
Otro descubrimiento contraintuitivo es que algunas parasomnias como caminar dormido, tener relaciones sexuales durante el sueño y hablar durante el sueño ocurren durante el sueño profundo, en lugar de hacerlo durante el REM como uno hubiera imaginado. Durante el sueño REM, los músculos esqueléticos se apagan, pero no durante el sueño profundo. Entonces, si ocurre un sueño o un patrón de activación similar a un sueño, el durmiente puede representarlo. A diferencia de las experiencias complejas del sueño clásico, las acciones del caminante del sueño tienden a ser simples y habituales, pero a veces pueden representar un peligro.
En general, sin embargo, es una buena regla general que “cuanto más profundo sea el sueño, mejor” debido a sus importantes funciones para el cuerpo y el cerebro. La falta de sueño de onda lenta en los ancianos se asocia con una mayor mortalidad. Es mejor instalar alarmas y colocar obstáculos para dormir caminando en lugar de renunciar a los efectos rejuvenecedores del sueño profundo.