¿Cómo afectan los alimentos genéticamente modificados al ADN humano?

Ellos no.

Existe una razón por la cual los virus usan métodos complicados para introducir su material genético (ADN o ARN) en una célula para su replicación. Sin ese mecanismo, comerías la cosecha y tal vez descompondrías las células y liberarías el ADN de la cosecha GM, pero después de eso no tiene camino por recorrer.
Los ácidos de tu estómago lo descomponen e incluso si queda algo de él, no hay forma de que pase una membrana celular para ingresar a una célula antes de ingresar al núcleo y alcanzar tu ADN. Además, no hay forma de que el ADN GM se replique o transcriba dentro de su cuerpo, por lo que literalmente no hace nada.

Para resumir, el ADN de GM Foods y el ADN humano no pueden encontrarse físicamente. Por lo tanto, hay cero posibilidades de interacción.

Parecería que no hay ningún caso registrado de secuencias genéticas modificadas en otras especies.

Sin embargo, existen vectores para la transferencia de secuencias génicas, especialmente en el mundo del virus, y la transferencia de virus a larga distancia (¿todos tenemos que llamarlos virus ahora?) Está bien documentada.

Entonces, si incluyese en una secuencia genética un gen con efectos perjudiciales conocidos, o uno que no tenga un efecto claramente beneficioso, parecería imprudente por decir lo menos. Sin embargo, incluir un gen natural que le da a langostino su color en el mundo natural en soja no parecería ser un gran riesgo, mucho menos un riesgo que, por ejemplo, incluir un gen completamente artificial que impida la producción de semilla del próximo año o etiquetas la secuencia como propiedad de alguna compañía de semillas.

Sin embargo, decir algo parece imprudente no es prueba científica de daño.