Sí. Está bien beber agua en cualquier momento. Lo que no debes hacer es beber mucha agua en un corto período de tiempo. Eso es para evitar la intoxicación por agua.
No puedo pensar en ninguna buena razón para esperar hasta que estés tan sediento que necesites un litro completo a la vez. Solo bebe cuando tengas sed. No importa si es antes, durante o después de una comida o un refrigerio.