La mayoría de las infecciones por gusanos son intestinales y, por lo tanto, se diagnostican mediante el examen microscópico de una muestra de heces para detectar la presencia de huevos. Por lo general, un experto necesita saber si lo que uno ve realmente es un huevo, y si es así, qué especie de gusano es. El diagnóstico puede involucrar algo llamado técnica de flotación de sulfato de zinc para concentrar los huevos y separarlos de la otra materia fecal para facilitar la detección e identificación.
Algunas lombrices cortan segmentos llamados proglótides, que pueden aparecer en las heces y son lo suficientemente grandes como para verse a simple vista. Estos generalmente serán blancos y tendrán forma rectangular (tenias de carne de res y de cerdo) o tendrán forma de pepino, que se estrechará hacia ambos extremos (una tenia gato / perro que infecta ocasionalmente a los humanos). Una gran lombriz llamada Ascaris ocasionalmente se arrastra por el ano, o vuelve por el otro lado e incluso puede arrastrarse por la nariz o la boca. Se parece un poco a una lombriz de tierra a excepción de una cutícula suave y la falta de segmentación. Las lombrices intestinales, que son pequeños gusanos redondos, a menudo salen del ano por la noche y causan picazón perianal. Un método de diagnóstico para estos es frotar alrededor del ano con cinta de celofán transparente para recoger los gusanos o los huevos en la cinta adhesiva, luego montar la cinta en un portaobjetos de microscopio y examinarla.
También hay gusanos que ocasionalmente infectan a los humanos y forman quistes en el hígado o el cerebro, y hay gusanos pulmonares cuyos huevos pueden aparecer en las heces o el esputo (flema).
