¿Cuáles son algunas formas de evaluar si tienes buenas bacterias intestinales?

¿Qué constituye una buena bacteria intestinal? ¿Cuál es su punto de referencia? No tenemos idea. La economía de la tecnología de secuenciación de genes implica costos de secuenciación de microbiomas fecales (1) una fracción de lo que hacía solo unos años atrás. Previsiblemente, las compañías que ofrecen secuenciarlas se han multiplicado, por supuesto, por un precio. Cualquier persona con un puñado de dólares estadounidenses desechables puede obtener su secuencia de bacterias popo, pero ¿qué significan esos resultados?

• ¿Debería contener popa ~ 55% de Firmicutes , aparentemente lo mismo que Michael Pollan o 74%, igual que el autor de esta pieza de Newsweek (2)?
• ¿Cuál es el valor de una secuencia única de bacterias poop? ¿No es solo una instantánea?
• Los estudios muestran que la composición bacteriana de la popa cambia rápidamente no solo con la dieta (3) sino también estacionalmente (4), ¿cuál es el valor predictivo de tal instantánea de todos modos?
• ¿Qué representa la bacteria popó?

• ¿No se secuencia tanto la bacteria caca porque es más fácil de acceder ?
• ¿Realmente no representa realmente las bacterias del colon distal apoyadas por la dieta actual?
• ¿Qué pasa con lo que está en el estómago, el duodeno, el yeyuno, el íleon y el colon proximal y transverso, y cómo se relacionan con la salud intestinal y general? ¿No necesitamos biopsias invasivas para acceder con precisión a las bacterias en otros compartimentos del tracto GI?
• ¿Qué podemos extrapolar de lo que está en caca a lo que debería ser en otras partes del tracto gastrointestinal? ¿Cualquier cosa? ¿Nada?

Todo esto para decir que se generan muchos datos sobre el microbioma de la caca simplemente porque puede ser, no porque alguien tenga una pista de lo que significa ni una pista de lo que constituye una buena bacteria intestinal.

Para colmo esta letanía de deficiencias y el dudoso valor de los intentos actuales de comparar las bacterias intestinales utilizando secuenciación de microbioma fecal, al menos un estudio aleatorizado controlado con placebo (5, 6) no solo revela nuevos poderes curativos incalculables de Placebo sino que también pone en duda la actualidad aceptaron nociones de bacterias intestinales “buenas” y “malas”.

• Un estudio en dos centros médicos académicos de EE. UU., Montefiore Medical Center en el Bronx, Nueva York y el Hospital Miriam, Providence, Rhode Island , ambos conocidos por su experiencia en el trasplante de microbiota fecal (FMT) (5, 6).
• 46 pacientes con infección recurrente por Clostridium difficile (CDI) fueron asignados aleatoriamente para recibir donantes o autógenos (su propia) microbiota de caca, es decir, Placebo.
• El 91% (20/22) de los que recibieron excremento de donantes se curaron de forma duradera según una definición estándar. Esperado así que no es sorpresa.
• ¿El shock absoluto? El 63% (15/24) que recibió su propia microbiota de popa trasplantada también tuvo una cura duradera . Frote los ojos y lea de nuevo. ¿Qué? A los pacientes con una infección grave del tracto gastrointestinal se les devolvió su propia bacteria intestinal supuestamente asociada a la enfermedad y se curaron.
• Aunque hubo sorprendentes diferencias entre centros en este efecto Placebo, 9/10 (90%) casos de placebo en el centro de Nueva York curaron versus solo 6/14 (~ 43%) en el centro de Rhode Island, y tal vez las diferencias en la población de pacientes asociados entre estos dos centros, estos no guardan relación con el problema central, a saber, una enfermedad del tracto gastrointestinal curada simplemente por eliminar y volver a poner bacterias fecales en pacientes con C.diff .

Por lo tanto, incluso las llamadas bacterias intestinales “malas” resultan no ser tan cortadas y secas, un resultado que solo subraya lo poco que sabemos actualmente sobre las bacterias intestinales, buenas, malas o cualquier cosa intermedia. Lo mejor que uno podría decir es que la ausencia de problemas de salud persistentes y serios, especialmente gastrointestinales, es evidencia de tener buenas bacterias intestinales. La ausencia de problemas en la piel, sin autoinmunidades o problemas de salud mental sería la guinda del pastel.

Bibliografía

1. secuenciación 16S rRNA

2. Newsweek, Roxane Khamsi, 17 de julio de 2014. Gut Check

3. David, Lawrence A., et al. “Dieta altera rápida y reproduciblemente el microbioma intestinal humano”. Nature 505.7484 (2014): 559-563. Dieta altera rápida y reproduciblemente el intestino humano
microbioma

4. Davenport, Emily R., et al. “Variación estacional en la composición del microbioma intestinal humano”. PloS one 9.3 (2014): e90731. http://www.plosone.org/article/f …

5. Kelly, Colleen R., et al. “Efecto del trasplante de microbiota fecal sobre la recurrencia en la infección recurrente por Clostridium difficile: un ensayo aleatorizado”. Anales de medicina interna (2016).

6. Trasplante fecal para la infección recurrente por C. Difficile

Gracias por el R2A, Jonathan Brill.

Puede extraer ADN de una muestra de materia fecal y enviarlo para análisis de secuencia de ARN ribosómico 16S bacteriano. Esto te diría qué especies están presentes y en qué proporciones.

Sin embargo, el microbioma de las personas varía y no hay consenso sobre en qué consiste un microbioma “bueno”. La promoción de un intestino sano comienza con una dieta bien balanceada y evitando los productos alimenticios altamente procesados. La mayoría de las veces, los suplementos probióticos son de poca utilidad porque las bacterias que contienen no son flora intestinal normal y no se quedan lo suficiente para mantener una población estable. Los beneficios que confieren, si los hay, son mínimos en el mejor de los casos. La excepción a la regla es cuando su microflora intestinal ya está afectada (por ejemplo, después de un tratamiento con antibióticos, síndrome del intestino irritable). En tal caso, el uso de probióticos “puede” ser de algún beneficio. Al decir eso, no todos los probióticos son iguales, y algunas especies (aún no se ha determinado cuál) son más beneficiosas que otras.

Uso de rRNA 16S y

Identificación bacteriana universal por PCR y secuenciación de ADN del gen 16S rRNA

Permítanme dar una idea del intestino y los microbios en el intestino (tan poco como sé) y luego tratar de determinar si un método directo válido (sin suposición, sin probabilidad, no puede haber) puede ser posible.

The Gut: (lo usaremos desde el comienzo del estómago hasta el final del colon / recto): ácido en el estómago, bilis en el intestino delgado, diferente secreción de biomoléculas, parcialmente anaeróbica a altamente anaeróbica, componentes de alimentos de múltiples tipos y su situación no digerida a la situación digerida como los materiales por movimiento, por movimiento intestinal, hacia abajo.

Los microbios: Desconocido. Aproximación: más de 1000 que varían fisiológicamente (facultativamente aeróbica a extremadamente anaeróbica), transitoria y permanente, capacidad de unirse o simplemente flotando, etc. De estos, en su mayoría desconocidos, solo unos pocos, muy pocos, se han identificado y se han caracterizado menos por su posible beneficio para la salud intestinal.

Con tantas variables desconocidas, no creo que actualmente estemos en condiciones de hacer una PRUEBA DIRECTA [como si tuvieras este error, por lo que tu intestino tiene buenas bacterias (las bacterias son plurales)]

Lo más probable es que al darse cuenta del estado de su GUT HEALTH, uno pueda asumir que el intestino tiene algunas bacterias buenas. Estos incluyen a una persona con factores de salud normales como: intensidad del hambre; tipo y cantidad de alimentos consumidos en un día (preferiblemente no muchos bocadillos entre las comidas principales, ningún medicamento, cantidad de alcohol consumido, digestión adecuada, regularidad en la defecación, consistencia del color, olor de las heces, etc. si son todo normal, lo más probable es que tenga poblaciones buenas bacterias en el intestino.

Es solo mi observación personal y mi opinión.

No se requiere ninguna prueba a menos que la persona experimente problemas gastrointestinales crónicos (diarrea, dolor, etc.), aunque en la mayoría de los casos eso no es causado por la flora intestinal sino por otro problema. La bacteria “buena” es simplemente una bacteria que no causa síntomas patológicos. La flora del intestino puede estar bien establecida, pero varía con el tiempo en función de la dieta (aquellos que pueden vivir de lo que les das de comer prosperan, mientras que aquellos que no pueden, no lo hacen).

La única manera de asegurarse, ya que no hay una prueba en particular, de tener una flora intestinal adecuada, es tomar suplementos bacterianos de alta calidad, como los productos de Key Biotics con cantidades extremadamente altas de diferentes bacterias y, al menos, más de 30 Un millón de unidades productoras de colonias (CPU) contenidas en.

De lo contrario, es posible que tenga una gran diversidad (o baja diversidad contraria) pero no lo sabrá.

ps Mencioné Key Biotics, porque en mi investigación, tenían la mayor diversidad bacteriana y la mayor cantidad de CPU.

A menos que quieras tomar biopsias y cultivos o muestras de heces, no hay otra manera.

¿Por qué querrías saber eso de todos modos? Las buenas bacterias en sus palabras son comensales y realmente no hacen mucho.

Casi todos los humanos adultos con una dieta variada los tienen.