¿Por qué hay dolor materializándose en el lado derecho del abdomen cuando se está ejecutando?

Parece que lo que está describiendo es lo que se conoce como dolor abdominal transitorio relacionado con la puntada lateral o el ejercicio (ETAP). Se cree que el dolor proviene de espasmos en el diafragma. El dolor del lado derecho se asocia con el estiramiento de los ligamentos que se extienden desde el diafragma hasta el hígado. Parece ocurrir más comúnmente con personas que exhalan cuando golpean el pie derecho en el suelo. Como se ha notado, también está asociado con el momento de la comida antes del ejercicio.

Aquí hay un enlace a una buena descripción de las causas y cómo prevenirlo:
La puntada lateral

desde mi experiencia, es cuando como menos de una hora antes de correr