¿En qué medida el sistema de salud está listo para el uso generalizado de la genómica personalizada?

Este es definitivamente el campo de batalla en este momento y según mis profesores, la gente ha estado diciendo durante los últimos 20 años que la genómica personalizada estará “en todas partes en 5 años”. Usamos genómica personalizada hasta cierto punto. Nuevas técnicas como aCGH le permiten trazar a una resolución relativamente alta el número de genes que tiene una persona en comparación con un genoma de referencia (probablemente Craig Venter porque Celera y el proyecto del Genoma Humano “ataron” en su búsqueda del primer genoma completamente secuenciado). Esto es de gran ayuda para encontrar inserciones y eliminaciones y es lo suficientemente barato para los consumidores

Lo que creo que estás preguntando es ¿cuándo podemos secuenciar el genoma de alguien para:

1. tratarlos mejor con medicamentos actuales
2. predecir con qué enfermedades podrían verse afectados

Entonces, usar la información genética para tratar a los pacientes de manera más efectiva con los medicamentos actuales se llama farmacogenómica. Te daré un ejemplo que con suerte saca a la luz las complejidades de esta situación.

La warfarina es un anticoagulante desarrollado en la Universidad de Wisconsin. La dosificación es un equilibrio: desea reducir la coagulación para efectos terapéuticos, pero no desea reducirla demasiado o el paciente se desangrará por los cientos de microdesgarros que su sistema vascular sufre cada día. El estándar actual de atención es medir su INR, básicamente su tiempo de respuesta de protrombina en un tiempo de respuesta de referencia (la protrombina es una proteína precursora que se escinde para convertirse en trombina, la enzima de coagulación del padre mayor). El problema es que las personas tienen polimorfismos en dos lugares, el gen responsable del metabolismo de los medicamentos (CYP2C9) y el gen que recicla la vitamina K (VKORC1, muy importante para la coagulación). Básicamente, si metabolizas el medicamento muy rápido y necesitarás más Warfarin, si lo metabolizas muy lento necesitarás menos. De modo que podemos analizar a los pacientes para detectar este polimorfismo y poder administrarles una dosis más adecuada, pero esto es costoso y no se ha demostrado que su implementación sea efectiva. Por lo tanto, debemos considerar una relación costo-beneficio antes de recomendar una evaluación generalizada.

Por otro lado, predecir enfermedades es extremadamente complejo. Trataré de simplificarlo para la persona lega incluso desde mi propio entendimiento simplificado de ello. Entonces, podemos pensar en las enfermedades como mendelianas (un solo gen) o multifactoriales (múltiples genes y medio ambiente).

Algunas enfermedades como la fibrosis quística (un trastorno de un solo gen) entendemos muy bien. Una mutación del gen CFTR, probablemente deltaF508 (70% de los pacientes tienen esta mutación), afecta a un transportador en los pulmones que conduce a la acumulación de moco. Sin embargo, solo porque tenga los genes para una enfermedad no significa que tendrá la enfermedad. Esto es porque la mayoría de las enfermedades tienen penetrancia incompleta. Y hay una serie de razones: medio ambiente, epigenética, epistasis, modificadores cis / trans, etc. Además, una parte importante del asesoramiento genético es la comunicación de la calidad de vida. Dos personas con fibrosis quística pueden tener fenotipos muy variables; a esto le llamamos expresividad variable.

Ahora imagina que para una enfermedad más común como el cáncer que no es causada por un solo gen, sino por múltiples genes y múltiples factores externos, predecir la enfermedad se vuelve mucho más difícil. Tenemos métodos para estudiar estos – Genome Wide Association Studies – pero a lo sumo solo pueden dirigirnos a nuevas vías, identificar lugares que pueden contribuir a la enfermedad y generar hipótesis. Todavía estamos muy lejos de la medicina genética predictiva y, sinceramente, estoy feliz de que sea así. Descubrirá que hay muchas implicaciones éticas en torno a las pruebas y que el paciente “conozca” su estado y no me gustaría vivir en un mundo tipo Gattaca sin autodeterminación.

Espero que esto ayude.

Si por genómica personalizada, en contraposición a la genética, te refieres a algo que se acerca a la secuenciación del genoma completo de un paciente, entonces el sistema no está listo para eso de forma generalizada, aunque solo sea porque simplemente no hay muchos escenarios clínicos donde, incluso dado toda la potencia computacional y el dinero necesarios para secuenciar los genomas del paciente de manera rutinaria (no es así), toda la información de la secuencia del genoma podría hacer una diferencia en el diagnóstico o tratamiento para esos pacientes. La secuenciación completa del genoma del paciente realmente solo tiene sentido ahora como investigación. Los genomas del cáncer se están secuenciando a un ritmo cada vez más rápido, y los genomas del paciente se están secuenciando para resolver nuevas enfermedades mendelianas o encontrar factores de riesgo genéticos para enfermedades complejas.

Para la secuenciación del genoma del cáncer y con el propósito de encontrar factores de riesgo genéticos para, por ejemplo, enfermedad cardíaca, podría tener sentido aumentar la secuenciación de todo el genoma para aumentar el poder de estos estudios asociativos, pero probablemente no hará una diferencia para esos pacientes en este momento.