¿Es verdad que los antivirales funcionan mal contra las infecciones agudas?

La respuesta es no, los antivirales pueden tratar infecciones virales agudas de manera efectiva (dependiendo de la droga y el virus por supuesto). Por lo general, no es una situación en la que nunca funcionan en absoluto.

Glaxo Smith Kline desarrolló un medicamento que puede tratar el Ébola durante el período de infección aguda, salvando vidas.
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El concepto completo de la profilaxis previa a la exposición para la terapia contra el VIH es que si una persona ya está tomando antirretrovirales durante la exposición aguda y la infección, nunca contraerá el VIH.

El tratamiento estándar para la insuficiencia hepática fulminante aguda por VHB aguda es la inhibición de la transcriptasa inversa.
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Los análogos de nucleósidos para inhibir una polimerasa viral serían efectivos en un escenario agudo para la mayoría de los virus, para responder a su segunda pregunta. Un inhibidor de la polimerasa para la rabia sería eficaz. En este momento, clínicamente, la administración de anticuerpos ha demostrado ser efectiva, lo que ha detenido la necesidad de otras opciones. Revise aquí para más información.
Diseño de futuros medicamentos biológicos contra la rabia y medicamentos antivirales.

Acyclovir es un tratamiento maravilloso para las infecciones agudas de herpes. La profilaxis posterior a la exposición para la exposición al VIH previene muchas infecciones. No tenemos tantos medicamentos antivirales agudos, pero existen.