1. El sistema inmunitario está protegido del entorno ácido del estómago por el revestimiento de su tracto gastrointestinal. Típicamente, tales patógenos simplemente han encontrado una manera de evadir nuestro sistema inmune.
2. El ambiente ácido del estómago a menudo se requiere para la funcionalidad de varios componentes del sistema inmune. Por ejemplo, las células que componen el revestimiento del tracto digestivo secretan varias proteínas que matan directamente a las bacterias y ayudan a expulsar los patógenos de nuestro cuerpo (produciendo moco, lo que induce peristalsis).