Es muy probable que sea alérgico a algo. Yo conjeturaría los ácaros del polvo que están en tu cama. También podría ser sensible a algunos químicos en su colchón / alfombra.
Si esto sucede solo durante el invierno, también sugiero usar un humidificador ya que el aire seco podría evitar que la mucosidad se drene hasta llegar al estómago y quede atrapada en la garganta. PERO los ácaros del polvo aman la humedad> 50%.
La mejor apuesta: obtener una prueba de alergia.