¿Cómo o por qué las bacterias causan los síntomas que vemos en las enfermedades comunes?

Tienes bacterias buenas y malas en todas partes. Las buenas bacterias mantienen su sistema digestivo en condiciones de trabajo. Tienes bacterias en tu piel. Las bacterias malas, generalmente conocidas como bacterias patógenas, entran en áreas que normalmente son estériles o superan a las buenas bacterias en el cuerpo y usted tiene un problema importante. Algunas de las enfermedades que resultan de malas bacterias son ecoli, samonella, gonorrea, por nombrar algunas.

Referencia healthgrades.com para más información.

Usualmente no lo hacen. Usualmente son las respuestas del cuerpo a la bacteria las que causan los síntomas que ves. Hay excepciones a la regla, como las bacterias que liberan neurotoxinas, etc.