Creo que es porque despertaste en medio de un ciclo de sueño que te deja más cansado que despertando entre ciclos de sueño. No importa si se despertó durante 4 horas o 6 horas u 8 horas, si se despierta en medio de un ciclo de sueño, se sentirá como si apenas pudiera dormir.
A veces utilizo este sitio web para decidir cuándo irme a dormir si tengo una prueba el día siguiente y preferiría despertarme más fresco que tener más horas; sleepyti.me hora de dormir calculadora